导致枸橼酸盐的回收减少，由于肠道缩短。引起尿液中上海人上海人论坛枸橼酸盐浓度下降，对结石结晶形成的抑制作用减弱，也有助于某些类型结石的形成。低枸橼酸尿也可能是因为尿液中细菌分解了枸橼酸。综合各种病例报道，各种尿流转向的患者中，有1/3患者尿液中枸橼酸盐的含量下降。局部回肠肠段采用较多的患者，可发生脂肪吸收不良导致肠道内脂肪酸增加，此时肠道内的钙可与脂肪酸结合形成粪石，与草酸结合的钙因此减少，导致被吸收的游离草酸增多，相应的尿液中草酸含量增多，也会增加草酸钙结石的发生。
主要是由于改变了肠管吸收状态。液体、电解质、营养物、废物的分泌与吸收都经过肠壁进行，物质交换异常也为尿流改道后常见的并发症。尿流转向后，这些过程将发生改变，主要受所选取的肠段、肠管表面积、尿液在肠管内停留的时间、尿液中各种成分的浓度、肾功能状态和血及尿液中pH值等因素影响。血清电解质紊乱的水平及类型取决于所选择的肠管，如选择胃代膀胱，会引起低氯性代谢性碱中毒，选择空肠导致低钠血症、高钾血症和代谢性酸中毒；选择回肠或结肠可能发生高氯性代谢性酸中毒。其他代谢异常包括低钾血症、低镁血症、低钙血症、高氨血症和血清中尿素氮和肌酐浓度升高等。
但到局部贮尿伪原创工具囊内结石的主要成分为磷酸钙和（或）草酸钙，尿流转向患者的泌尿系结石多为感染性结石。提示代谢性因素也参与了结石的形成。研究发现分别接受kock膀胱、Indiana膀胱和回肠输出道手术的患者，其尿液的电解质成分明显不同。可控性贮尿囊能引起尿液中钙、磷、镁含量增加，这些因素有可能促进结石的形成，而回肠输出道患者对尿液成分的影响较小，与正常人尿液基本相同。
导致肠道对这些物质的再吸收增加，这可能是因为尿液在贮尿囊中停留的时间较长。相应的肾排泄增加。由于回、结肠代膀胱更易导致低氯性酸中毒，后者可引起骨质脱矿质，血清中钙、磷等离子含量增多，肾小管分泌也相应增加，也可引起尿中钙、磷等成分增加。同时，酸中毒可以抑制肾小管对钙离子的吸收，相应地增加钙离子的排泄。
肾小管排泄硫酸根离子增加，贮尿囊内的再吸收常随同硫酸根离子吸收增加。也可抑制钙离子的吸收。另外，尿流转向患者尿液中氨或游离氢离子回收增加、尿液中产生酶的细菌感染以及肾小管碳酸氢离子分泌增多，可导致尿液pH值增高。
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